技能机（TM）和秘传机（HM）是提升宝可梦能力的关键道具。HM01居合斩可在枯叶市圣安奴号的船长室获得，击败船长后他会赠送该技能机。HM02飞天位于彩虹市左侧卡比兽挡路的屋子里，与女孩对话即可取得。HM03冲浪需在野生原野区最深处的小屋内与NPC对话获得。HM04怪力需将野生原野区找到的金牙交给园长后换取。HM05闪光在拥有10种以上宝可梦图鉴后，穿过地鼠洞穴与博士助手对话领取。HM06碎岩在一岛的洞穴内由白胡子老头赠送。HM07鱼跃龙门位于四岛阴森洞穴深处。部分技能机如TM28挖洞在华蓝市击败火箭队成员后掉落，TM34电磁波则需击败枯叶市电系道馆馆主马志士后获得。
游戏初期从真新镇出发，选择妙蛙种子、小火龙或杰尼龟作为初始宝可梦。与劲敌小茂首次对战后，前往常磐市商店取得包裹并交还大木博士，获得宝可梦图鉴。穿过常磐森林抵达尼比市，击败岩石系馆主小刚取得灰色徽章。月见山剧情中需选择化石盔或菊石兽化石，之后在华蓝市击败水系馆主小霞。圣安奴号事件后取得居合斩，用于清除枯叶市道馆前的障碍。电系道馆需连续调查两个垃圾桶触发机关，击败馆主后获得橘色徽章。
彩虹市游戏厅海报后的秘道可进入火箭队基地，击败地下四层小兵取得电梯钥匙，最终与坂木老大对战并获得观测镜。紫苑镇宝可梦塔需用观测镜识别幽灵宝可梦，解救富士老人后取得宝可梦笛子，用于唤醒挡路的卡比兽。野生原野区需支付500元进入，限时600步，内部可捕捉稀有宝可梦并获取关键道具。
后期挑战包括超能系馆主娜姿和毒系馆主阿桔。彩虹市百货公司可购买多种技能机，如TM15破坏光和TM24十万伏特。通关后若集齐60种宝可梦，大木博士会升级图鉴。三神鸟捕捉地点明确：火焰鸟在1号岛灯火山顶，闪电鸟位于无人发电厂深处，急冻鸟需在双子岛推石头堵住瀑布后遭遇。超梦则隐藏在华蓝洞窟底层，需携带冲浪和攀瀑技能的宝可梦才能抵达。
技能搭配与队伍构建需注重属性平衡。火系技能克制草、虫、钢系，但需避免被水系或岩石系反制。冲浪与飞行技能可优化地图探索效率。宝可梦等级提升可通过冠军之路训练或使用幸运蛋加速经验获取。游戏内隐藏道具如进化石和特性胶囊需仔细探索，部分NPC会赠送稀有道具或宝可梦。
游戏机制上，秘传机技能需通过遗忘老人才能删除，且部分地图技能需对应徽章才可使用。战斗外技能如闪光和碎岩能解锁新区域。联机交换可进化特定宝可梦，如勇吉拉进化胡地。游戏内时间事件和隐藏剧情需多次探索才能完全触发，建议定期存档以避免进度损失。
